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“寨卡”病毒潜伏期为3-12天，临床表现与登革热和基孔肯雅热十分相似，主要为低烧，瘙痒，红疹，关节痛，肌肉痛以及非化脓性结膜炎等。
寨卡病毒之所以被人类关注，主要是目前的报道显示，它与新生儿小头症高度相关，可引起人类的格林巴利综合症。病毒感染并不致命，通常病情比较温和，症状可持续数日至一周，无需住院治疗。人感染后可获得持久的终身免疫，目前没有感染后再次感染的报道。但该病毒可以通过性传播和母婴传播，且孕妇感染寨卡病毒后，其产下的婴儿可能会出现小头症，导致新生儿畸形并留下后遗症。
